生态环境管理与政策研究中心为我所的二级处级机构，主要面向国家和地方需求开展生态文明和绿色发展理论与方法研究，负责环境经济政策、环境技术政策实践和应用研究；开展生态空间规划、战略与规划环评等理论、技术和应用研究；承担以生态环境质量改善为核心的全链条环境管理及政策支撑任务；负责海岸和海洋工程生态环境影响评价工作，开展陆海统筹环境管理研究。承担广东省重点智库的决策咨询任务。
中心下设生态环境政策研究室、区域环境评价与管理研究室、生态环境资源调查与评估研究室和企业环境管理与政策研究室共4个研究室，另外还设置有政府环保责任考核、环评技术评估团队。
中心现有42名人员，其中研究员（正高级工程师）2名，副研究员（高级工程师）19名，工程师14名，助理工程师7名。
（一）生态环境政策研究室（简称政研室）
负责生态文明和绿色发展理论和方法研究，开展生态空间规划技术研究与应用，承担生态文明建设及绩效考核、生态环境规划等工作， 建设广东省绿色发展重点智库。
（二）区域环境评价与管理研究室（简称区域评价室）
开展战略/政策、区域与规划环评理论、技术和应用研究，承担“三线一单”编制与动态评估、区域/流域/产业发展环境评价、海岸和海洋工程生态环境影响评价工作，拓展基于陆海统筹的区域环境管控研究。
（三）生态环境资源调查与评估研究室（简称调查评估室）
开展生态环境资源资产监管、资源环境承载预警、生态服务功能评估等应用研究，开展水土流失管控全过程技术方法和管理研究，承担生物多样性、水土资源及生态状况调查评价、生态环境资源利用规划等工作。
（四）企业环境管理与政策研究室（简称企业管理室）
开展基于生态环境质量改善的排污许可环境管理、环境影响评估技术研究，承担区域开发环境监理、环境影响后评价、生态环境信息披露等工作。
